灌云县辖8个镇、12个乡：伊山镇、板浦镇、杨集镇、燕尾港镇、同兴镇、四队镇、圩丰镇、龙苴镇、伊芦乡、鲁河乡、图河乡、沂北乡、下车乡、白蚬乡、东王集乡、侍庄乡、小伊乡、穆圩乡、陡沟乡、南岗乡；东辛农场、五图河农场、灌西盐场。

【沿革】？年辖7个镇、19个乡：伊山镇杨集镇同兴镇四队镇板浦镇龙苴镇燕尾镇宁海乡鲁河乡穆圩乡东王集乡白蚬乡东辛乡陡沟乡伊芦乡小伊乡图河乡下车乡向阳乡侍庄乡界圩乡南岗乡伊山乡沂北乡圩丰乡

2003年辖8个镇、13个乡。

根据江苏省政府《关于同意调整连云港市部分行政区划的批复》（苏政复[2005]37号）和连云港市政府《关于将灌云县宁海乡划归新浦区管辖的通知》（连政发[2005]111号），将灌云县宁海乡整建制划归新浦区管辖。行政区划调整后，灌云县行政区域面积1834.56平方千米，人口104.55万，辖8个镇、12个乡。